El Programa de Admisión Especial (PAES) se establece en la Universidad a mediados de la década de los años 80 y está dirigido a grupos poblacionales que por sus condiciones sociohistoricas han sido excluidos del sistema de educación y de la educación superior en nuestro país.
Actualmente se cuentan con cinco modalidades PAES: bachilleres de comunidades indígenas (1986), mejores bachilleres de municipios pobres (1989), mejores bachilleres del país (1990), bachilleres de población negra afrocolombiana, palenquera y raizal (2009) y víctimas del conflicto armado interno en Colombia (2015).